I anvisningarna för miljötillsynen behandlas tillsyn enligt miljöskyddslagen, avfallslagen, vattenlagen och miljöskyddslagen för sjöfarten. Anvisningarna är i första hand avsedda för statliga tillsynsmyndigheter, dvs. för närings-, trafik- och miljöcentralerna. Kommunerna kan emellertid enligt prövning använda anvisningarna eller en del av dem när de planerar och utövar miljötillsyn. I bilaga 1 beskrivs god tillsynspraxis för små och medelstora kommuner.

Anvisningarna för miljötillsynen innehåller en allmän del, en lagspecifik del och bilagor. I den allmänna delen av anvisningarna behandlas principerna för miljötillsynen och fastställs när tillsynsmyndigheten bör vidta administrativa och rättsliga åtgärder för utförandet av sin tillsynsuppgift. I den lagspecifika delen behandlas de mest centrala författningarna med hänsyn till miljötillsynen och beskrivs mer ingående i vilka situationer speciallagar tillämpas. I bilagorna ges bland annat rekommendationer om tiden för handläggning av olika anmälningar i anslutning till tillsynen och om förfaringssätt vid exceptionella situationer. Ändringar som gjorts i miljöskyddslagstiftningen har tagits i beaktande i anvisningarna.

Anvisningarna för miljötillsyn har samordnats med Ympäristönsuojelulainsäädännön laillisuusvalvontaopas 2014 (Handledning om övervakning av miljöskyddslagstiftningen, Miljöförvaltningens anvisningar 9/2014) och dessa två ska helst läsas parallellt.